Karta cheat Conda - parametry wiersza poleceń Anaconda - najbardziej przydatne polecenia conda

Zapomniałeś parametrów polecenia conda?

Page content

Oto cheatshet z Conda, który stworzyłem kilka czasów temu…
Ten cheatsheet z Conda obejmuje najważniejsze polecenia i wskazówki dotyczące zarządzania środowiskami, pakietami i kanałami które znalezłem przydatnymi.

Spokojny conda

Przejrzyj uv - nowy menedżer pakietów, projektów i środowisk Pythona

Instalacja i aktualizacja Conda

Sprawdź instalację i wersję Conda:
```
conda info
```
Zaktualizuj Conda:
```
conda update conda
```
Zaktualizuj metapakiet Anaconda:
```
conda update anaconda
```

Zarządzanie środowiskami

Utwórz nowe środowisko:

conda create --name my_env
conda create -n my_env python=3.8  # Określ wersję Pythona
conda create -n bioinfo fastqc trimmomatic bwa  # Utwórz z konkretnymi pakietami

Aktywuj środowisko:

conda activate my_env  # W systemach Windows, Linux, macOS
source activate my_env  # W systemach Linux, macOS (stary składnia)

Wyłącz środowisko:
```
conda deactivate
```
Wyświetl wszystkie środowiska:
```
conda env list
conda info --envs
```

Skopiuj środowisko:

conda create --clone old_env --name new_env

Zmień nazwę środowiska:
```
conda env rename -n old_env -d new_env
```

Usuń środowisko:

conda env remove -n my_env
conda remove --name my_env --all

Wyświetl wersje środowiska:
```
conda list --revisions
```

Przywróć środowisko do wersji:

conda install --rev 3  # Przejdź do wersji 3

Zarządzanie pakietami

Wyświetl zainstalowane pakiety:

conda list
conda list -n my_env  # Wyświetl pakiety w konkretnym środowisku

Zainstaluj pakiet:

conda install package_name
conda install -c conda-forge package_name  # Zainstaluj z konkretnego kanału
conda install package_name=1.2.3  # Zainstaluj konkretną wersję

Zaktualizuj wszystkie pakiety w środowisku:
```
conda update --all
```

Usuń pakiet:

conda remove package_name
conda remove --name my_env package_name  # Usuń z konkretnego środowiska

Wyszukaj pakiety:

conda search package_name
conda search -c conda-forge package_name  # Wyszukaj w konkretnym kanale

Praca z kanałami

Wyświetl kanały:
```
conda config --show channels
```

Dodaj kanał:

conda config --add channels conda-forge
conda config --prepend channels conda-forge  # Dodaj jako pierwszy
conda config --append channels bioconda  # Dodaj jako ostatni

Ustaw priorytet kanałów:

conda config --set channel_priority strict

Eksportowanie i importowanie środowisk

Eksportuj środowisko do pliku YAML:

conda env export > environment.yml
conda env export --from-history > environment.yml  # Eksportuj tylko jawnie wymienione pakiety

Importuj środowisko z pliku YAML:

conda env create --name my_env --file environment.yml

Eksportuj środowisko do pliku tekstowego:
```
conda list --export > requirements.txt
```

Importuj środowisko z pliku tekstowego:

conda create --name my_env --file requirements.txt

Dodatkowe polecenia

Pomoc dla polecenia:
```
conda -h
conda install -h
```
Wyczyść niepotrzebne pliki:
```
conda clean --all
```

Przejrzyj konfigurację Conda:

conda config --get
conda config --get channels

Mamba (opcjonalnie)

Mamba to szybszy alternatywa dla Conda, ale ma pewne ograniczenia, szczególnie co do wersji środowisk.

Zainstaluj Mamba:
```
conda install -c conda-forge mamba
```
Użyj Mamba zamiennie z Conda: Większość poleceń jest taka sama, ale Mamba nie obsługuje cofania wersji środowisk.

Wskazówki

Używaj opisowych nazw środowisk: Pomaga w zarządzaniu wieloma środowiskami.
Aktywuj środowisko przed instalacją pakietów: Gwarantuje, że pakiety zostaną zainstalowane w odpowiednim środowisku.
Używaj konkretnych kanałów do pakietów: Gwarantuje, że otrzymasz pakiety z żądanych źródeł.
Unikaj konfliktów zależności: Zainstaluj wszystkie programy w środowisku jednocześnie.